Кошачий Генетика: Клиническое применение и генетическое тестирование.Каридиомиопатия

Взято с сайта http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3073564/   с использованием Google переводчика,

Лесли А. Лайонс , доктор философии

Окончательного варианта издателя этой статьи можно найти на Топ Companion Anim Med

Абстрактный

ДНК-тестирование для домашней кошки заболеваний и появления признаков является быстро растущей активом для ветеринарии. Приблизительно тридцать три гены содержат пятьдесят мутации, которые вызывают проблемы со здоровьем кошачьих или изменения во внешнем виде кошки. Разнообразие коммерческих лабораторий теперь может выполнять кошки генетическую диагностику, что позволяет как ветеринарный врач-клиницист и частного владельца для получения результатов ДНК теста. ДНК легко получается из кота через ротовой мазок с помощью стандартного ватным тампоном или цитологический кисть, позволяя образцы ДНК, чтобы быть легко отправлять на любой лаборатории мира. Результаты испытаний ДНК определить носителей признаков, прогнозирования случаев черт из селекционных программах, и влиять на медицинские прогнозы и методы лечения. Общая цель выявления этих генетических мутаций является коррекция дефекта с помощью генной терапии и дизайнерских лекарственной терапии. Таким образом, генетическое тестирование является эффективным профилактической медицины и потенциальный конечной лечения. Тем не менее, генетические диагностические тесты все еще может быть роман для многих ветеринарных практиков и их применение в клинической практике необходимо иметь такого большого внимания, как и любой другой диагностической процедуры. Этой статье будут рассмотрены генетические тесты для домашней кошки, потенциальные источники ошибок для генетического тестирования, а также плюсы и минусы результатов ДНК в ветеринарии. Выделенные генетические тесты, специфичные для отдельного кошки, которые являются частью внутреннего генома кошки.
Ключевые слова: домашняя кошка, ДНК, кошачьи, генетическое тестирование, мутации

Простые генетических признаков

Появление кошки, ее фенотип, и его здоровье может быть под влиянием как генетических (наследуется) и негенетическими (экологических) влияний. Заболевания и черты, которые известны мутации, следовательно, четко наследственные и генетические, как правило, называют простые генетические черты, как презентации контролируются в основном одной специфической мутации в одном специфического гена. Потому что эти черты "простой", большинство первоначально обнаруженных мутаций в любых видов были в течение четко генетических признаков, которые имеют высокие частоты в отдельных группах населения. Первые мутации, выявленные у кошек были для липидов и хранения лизосомальных болезней в начале и середине 1990-х годов 1 , 2 , [J1], поскольку эти заболевания имеют четко определенные фенотипы и известные гены с мутациями, которые были, как у людей (Посмотреть отзывы 3 , 4 ). Большинство распространенных заболеваний, окрасов и типов шерсти были расшифрованы в кошки следующим гена подхода же кандидата, что подразумевает нахождение репликации черту в другого вида и проверки тот же ген для причинных мутаций. Представленный в таблице 1 являются коммерчески доступные простые генетические черты и болезни с известными мутациями в кот. Другие мутации болезни представлены в таблице 2 . На сегодняшний день, кроме мышечной дистрофии мутации 1 , все другие мутации в кошки являются аутосомно, не найдено на хромосомах X или Y.
 

Другие Мутации для унаследованных внутренних болезней Cat

В окраса мутации являются общими для всех кошек и вступают в силу для генотипирования во всех пород и популяций. Тем не менее, даже при том, длинный мех является общим в пород и случайных разводят кошек, длинный мех является исключением, поскольку четыре различных мутаций в FGF5 может вызвать у кошки, чтобы иметь длинный мех 5 , 6 [J2]. Один мутации является общим для большинства всех пород и популяций, предполагая, что эта мутация быть самая древняя мутация, но другие являются более характерными для конкретных пород 7 . Таким образом, для точного определения, если кошка несет мутацию для длинным мехом, все четыре мутации должны быть генотипированы.
В отличие от окраса и длинным мехом, большинство из выявленных испытаний болезни у кошек очень специфичны для пород и популяций. Большинство заболеваний выявляются в пород кошек, которые являются небольшой процент кошки населения мира, возможно, не более 10-15% в США 8 . Некоторые мутации, которые были найдены в конкретной породы, такие как мукополисахаридоза в сиамских 2 , 9 , были найдены в конкретного человека и мутация на самом деле не распространены в породе ( табл. 2 ). Эти генетические мутации не должны быть частью рутинного скрининга на кошек заводчики и реестров, но врачи должны знать, что генетические тесты для диагностических целей, особенно из исследовательских групп с специализированной экспертизы, например, в Университете Пенсильвании ( http://research .vet.upenn.edu / penngen ). Другие биомаркеры также доступны на этих специализированных лабораторий, чтобы помочь расшифровать между хранения лизосом и метаболизма заказов. Другие заболевания, такие как поликистоз почек (ДОК), широко распространены, ПКД в персов оценивается в 30-38% во всем мире 10 - 12 . Из-за скрещивания с персами, многие другие породы, такие как британские короткошерстные, американских короткошерстных и шотландских фолдов, также должны быть обследованы на ДОК 13 - 15 . Таким образом, ветеринары должны быть в курсе практики скрещивания, которые отличаются в разных организациях кошка реестра, так что генетические тесты могут быть размещены в высокий или низкий приоритет для дифференциалов и диагностики.
Негенетические компоненты, в том числе токсины, инфекции, инвазии, спорадической повреждений и изменений в ДНК и воздействий окружающей среды, таких как диета, физические упражнения и социальным окружением, может произвести фенотип, который выглядит так же, как наследственная характеристика или заболеваний, фенокопии. Подробные исследования кошек с шумы в сердце может выявить различные презентации болезни сердца, один, который может быть генетическая и один, который может быть экологически индуцированной, например, путем низким диетическим таурина в результате дилатационной кардиомиопатии 16 . Некоторые заболевания могут представлять по-разному в различных тканях, называют как plieotrophic эффектов одного и того же гена. Например, полностью белые кошки может быть только белый, в то время как другие имеют голубые глаза или нечетное глазами цвет и некоторые из них могут быть глухими 17 - 19 . Генетическое тестирование может помочь врачу, чтобы исключить общие и экологических причин клинических проявлений по сравнению с состояния, вызванного наследуемого дефекта в ДНК кошки.

Клейма генетических заболеваний

Фенотип кошки представляет собой сочетание наличие заболеваний, видимых признаков или морфологических типов. Атрибуты фенотипа может быть желательным или нежелательным, особенно в случае заболеваний. Потому что фенотипы могут быть результатом одного гена, взаимодействие нескольких генов, накопление воздействия окружающей среды, или из комбинации взаимодействий, ветеринар может выбирать различные типы терапии, клиническое управление, или делать различные прогнозы, если фенотип Известно, что генетическая. Если же условие найдено у других видов, ветеринар может иметь возможности, чтобы попытаться новые подходы в области здравоохранения с учетом сравнительного лекарства. Некоторые характеристики являются общими для генетических заболеваний, которые помогут расшифровать спорадические, идиопатический, вхождения от наследственных заболеваний.
Шесть общие отличительные для наследственных заболеваний включают в себя: 1) ранний возраст начала, 2) двусторонние и / или несколько презентаций, 3) наличие в закрытом или небольшой численностью населения, 4) признаки инбридинга, 5) единообразия в представлении, и 6) расширенный родительский возраст при рождении. Только преклонный возраст родителей при рождении не было показано, что эффект в кошки наследственных заболеваний. У человека, старшего матери имеют более высокую частоту рождения детей с трисомии 21 20 и карликовость связана с передовой отцовской возраста 21 .
Два примера заболеваний, которые представляют как спорадические и унаследованные формы являются ПКД 22 и лимфосаркома 8 . Каждый из пяти характеристик, определяющих генетические заболевания может помочь определить ДОК от кошек с спорадических кист в почках. Почки кисты может произойти в любой кошки, но не все кистозные презентации свидетельствуют о ДОК. ПКД иногда могут быть обнаружены уже в 6 до 8-недельного возраста ультразвуком, последовательно 10 месяцев 14 . Обе почки, как правило, влияет и множественные кисты обычно присутствуют. Кисты не похожи по размеру, но схожи по этиологии. ПКД свирепствует в персидских кошек, таким образом, должны рассматриваться, чтобы присутствовать в смежных пород, таких как Экзотических короткошерстных и Гималаи. Удивительно, но это генетическая проблема имеет очень высокую частоту в одном из старейших и крупнейших пород кошек, при этом не небольшой или закрытой популяции, но раннее начало, двустороннее представление, и высокая распространенность в породе четко разграничить это состояние как наследственные проблема. Пожилой, случайный разводят кошка с одной кисты почки в одной почки не будет кандидатом на ДОК и генетического тестирования.
Лимфосаркома также часто у кошек, но это, как правило, встречается у пожилых кошек и / или кошек, которые были инфицированы и являются положительными для FeLV 23 . Обычная норма медиастинальной лимфосаркомы был специально определены в серебряных восточных короткошерстных, которые ВЛК отрицательный и вообще моложе 2 лет. Мало того, что порода влияние подозревается в этой болезни, но даже определенный цвет или линия. Другие родственные породы, такие, как сиамские, Colorpoint короткошерстных и длинношерстных разновидностей сиамских следует подозревается распространенность этой лимфомы. Возраст начала составляет 1-2 лет, а опухоли хорошо поддаются химиотерапии, но повторяться с плохим прогнозом. Таким образом, это заболевание находится в закрытом, инбредной популяции, имеет раннее начало и обычно единообразного представления и опухоль находится в области, не являются общими для пожилых натиска форм лимфосаркомы. Эти клейма определить наследственные состояния по сравнению спорадических лимфом, происходящих в старых возрасте кошек.

:Генетические факторы риска и сложных признаков

Генетическая проблема с высокой частотой можно найти почти в каждом классе, таким образом, не одна порода вообще не может считаться здоровым, чем другой. Вредные гены находятся в случайных разводят кошек также, но с низким инбридинга предотвращает рост заболеваемости в проявлений болезни. Тем не менее, для рецессивных или доминантных заболеваний, которые не вызывают рано клинические проявления, селекционеры могут быть в полном неведении о распространении вредного гена. Некоторые породы могут также иметь проблемы со здоровьем, генетическая и не-генетические, из-за конформации или «типа», требуемой для породы. Укороченные структуры черепа и носовые каналы вызвать персы иметь плачущие глаза, асимметричные черепа и плохой укус 24 . Занимательно, что мелкие, изящные структуры абиссинцев и сиамских кошек усугубить вывих надколенника. Крупнейший порода, мейн-кун, находится под следствием по делу о дисплазии тазобедренного сустава [J3], очень распространенная проблема в больших пород собак. Скорее всего, эти более сложные проблемы имеют генетический компонент, но определения количества и повлиять генов трудно, таким образом, рекомендации для более эффективной практики разведения может быть более ценным, чем генетическое тестирование.
Все мутации, влияющие на заболевание не могут быть идентифицированы в любой момент времени, таким образом, обычно мутации, которые влияют на состояние всего, имеют самую высокую наследуемость, определены в первую очередь. Поскольку многочисленные мутации могут действовать аддитивно, чтобы вызвать заболевание, каждый мутации, можно сказать, создают "риск" для развития болезни. Таким образом, некоторые мутации могут быть рассмотрены факторы риска, предрасполагающие человеку проблемы со здоровьем. Эти риска присвоении мутации не являются ни необходимым, ни достаточным для вызывая болезни. Прекрасным примером мутаций, которые придают риск являются варианты ДНК, связанные с заболеваниями сердца у кошек.
Гипертрофическая кардиомиопатия (HCM) является признанным генетическое состояние у кошек 25 . В 2005 году д-. Мерс, Kittleson и его коллеги опубликовали, что изменение ДНК в гене сердечной миозина-связывающего белка С 3 (MYBPC3) был тесно связан с HCM в долгосрочной исследовательской колонии Мейн кун кошек в UC Davis 26 . Мутация ДНК обычно называют A31p, как эта ДНК мутационных изменений кодонов 31 из аланина к пролина в аминокислотной последовательности (т.е. белка) из cMYBPC. Данные ясно показывает, что не все кошки с мутацией были HCM и что некоторые кошки с HCM не было мутацию ДНК. Возраст начала, и выражение переменной, и неоднородности заболевания были упоминается в данном отчете. Эти аспекты показывают, что определены вариант ДНК должны быть рассмотрены более "фактор риска", чем непосредственно причинного мутации. Два недавних работах показали, что не все кошки Мейн-кун с мутацией A31p получить HCM 27 , 28 и один из этих документов ошибочно истолковал это отсутствие пенетрантностью как доказательство того, что мутация A31p не причинным 28 . Эта интерпретация вводит в заблуждение, вызывая дебаты по поводу действительности теста Мейн-кун HCM.
На сегодняшний день большинство кошек генетические тесты были для признаков, которые имеют почти полную пенетрантность, имеют мало изменчивость в выражении, и которые рано начала. Тем не менее, некоторые несовершенные примеры существуют в кошек, которые не вызвали столько споров как тест HCM. Мутация CEP290 ПРА в абиссинцев есть поздний возраст начала и некоторые кошки с субклиническим заболевания были выявлены 29 . Некоторые кошки с пируват дефицита киназы может иметь очень слабые и субклинические презентации 30 . Взаимодействие различных генов пальто цвета часто путаница определение истинного окраса кошек. Как истинный у людей с заболеванием сердца, обнаружении того, что не все кошки с A31p мутации в MYBPC3 получить НСМ на самом деле обычно в области НСМ генетическое тестирование. Таким образом, болезнь или Trait вызывая мутации не может быть 100% пенетранта, таким образом, они не всегда вызывают клинически детектируемого заболевание. Наличие клинического заболевания в отдельной кошки и тяжести заболевания (выражение), вероятно, пострадавших от известных генетических аспектами, представленными ниже:
1.    Неполной пенетрантностью - для некоторых черт и болезней, хотя известно мутация причинным было выявлено, человек с этой мутацией не представляет с условием. Неполной пенетрантностью является крайней переменной выражения (см. ниже). В общем, причина того, почему условие не будет представлять, неизвестно, но другие генетические, биологические и экологические взаимодействия, безусловно, играют важную роль в общий вид и здоровье человека и его органов. Чувствительность клинической диагностики может также влиять на определение пенетрантностью. В случае ГКМ, эхокардиографию (УЗИ сердца) может рассматриваться как нечувствительный инструментом для обнаружения мягкие формы ГКМ у кошек, таким образом, много кошек с легкой не клинически, как представляется, заболевания сердца. Опыт и смещения также играют важную роль в диагностике. Например, лица, которые не имеют опыта работы с ультразвуковыми экзаменов для HCM или ДОК, менее вероятно, чтобы быть в состоянии обеспечить точный диагноз этих заболеваний.
2.    Возраст начала (возрастная пенетрантности) - некоторые болезни у вас медленный прогресс и не может представить позднее в жизни. У людей, HCM из-за MYBPC мутаций, безусловно, является болезнью, которая имеет медленное прогрессирование и обычно не выражает пока человек не является более 50 лет. HCM в Мейн кун кошки также может развиваться у пожилых кошек, особенно у кошек, которые гетерозиготных по мутации (выполнять только одну копию мутировавшего гена) и, по неизвестной причине, у женщин. Часто, доминантное заболевание аутосомно могут быть более серьезными, если две копии мутации риска присутствуют в человеке, что приводит к более раннее и более тяжелое заболевание, которое, как представляется, в случае с мутацией A31p. Окончательный возраст, чтобы, когда кошка ясно развития HCM является точно не установлено.
3.    Переменная выражений - большинство черты и болезни есть некоторое количество выражение переменной в зависимости от личности. Например, не все кошки с мутацией для голубого разведения имеют одинаковый цвет синий / серый. Очевидно, фоновые генетика и окружающая среда индивидуального влияния общие презентации черт и болезней. Таким образом, уровень представления может быть переменной в отношении левой толщины стенки желудочка у кошек с ГКМ. Кошки могут иметь мягкий, средней или тяжелой HCM. Только те кошки с тяжелым HCM показать клинические признаки хотя несколько кошек с меньшей тяжести заболевания может внезапно умереть. Кошки с HCM может упасть в "сомнительном" диапазона для толщины стенки, таким образом, окончательное пострадавших статус трудно объявить. Эти сомнительные кошки может перейти в более тяжелой болезни со временем, или двусмысленным статус может быть столь сильным, как болезнь становится. Некоторые кошки с ДОК есть только несколько кисты и никогда не прогрессировать до почечной недостаточности, другие имеют серьезные и быстро прогрессирование болезни и поддаваться почечной недостаточности в течение нескольких лет.
4.    Болезнь Гетерогенность - часто, более чем одну мутацию в том же гене, или мутации в различных родственных генов может привести к тем же заболеванием. Генетическая гетерогенность для HCM в людях хорошо известна, таким образом, нет никаких причин, чтобы не думаю, что такая же ситуация верно для кошек. В настоящее время более 1000 мутаций в более чем 10 генов как известно, вызывают HCM в организме человека. Только два мутации были идентифицированы, что причина HCM у кошек, в A31p мутацию в Мейн кун кошек и мутации R820W в Ragdolls 26 , 31 , которые также вызывает заболевание у людей 32 . Обе мутации в MYBPC3, наиболее часто мутантный ген у людей с HCM (см. обзор 33 ). Другие породы кошек в том числе Bengals, сибиряков, Девон рекс, и Сфинкс и смешанных пород кошек либо не имеют или имеют крайне низкую распространенность A31p или мутации R820W. Однако, есть Мейн-кун кошки, которые имеют HCM, которые не имеют мутацию A31p и так там должен быть по крайней мере еще одной из причин HCM, скорее всего, другой мутации, в этой породе. Длинные меховые мутации в кошки являются примерами признака неоднородности.

5.    Генетическое тестирование точность - хотя конкретная генетическая мутация может быть идентифицирован на генетический признак или заболевания, научно-исследовательские лаборатории используют различные методы для анализа на наличие мутации. Ошибки в генетических анализов могут выдавать неточные результаты, ДНК, что приводит к путанице генетической интерпретации теста. Прямая секвенирования ДНК считается наиболее надежный метод, "Золотой стандарт", но и одним из наиболее дорогостоящих методов анализа. Поскольку ДНК-праймеры должны привязать к последовательности ДНК флангового определенную мутацию, другие, незначительные мутации могут быть в тех областях, где праймеры связываются, в результате чего с плохим или нет усиление одного или обоих аллелей для данного индивида. Это состояние известно как аллельной отсева и все испытательные лаборатории знают об этом потенциальный источник ошибок для генетического теста. Даже прямое секвенирование ДНК могут страдать от аллелей отсева, а потому, что большая часть гена, которая может иметь другие варианты ДНК, как правило, усиливается, более высокая вероятность обнаружения аллельный отсева доступно. Лаборатории разместит праймеров ПЦР в разных местах, окружающих мутацию интерес, который часто служебной информации, в попытках снизить риск аллельной отсева. Таким образом, некоторые лаборатории имеют лучшие анализов, чем другие, даже если они делают тот же метод анализа и тестирования по той же мутации. Различные методы анализа ДНК, как правило, разработаны для снижения затрат и, чтобы соответствовать экспертизу лабораторным и приборов. Но, некоторые анализы могут иметь, в общем, немного увеличенный риск ошибки теста. Различные общие методы анализа ДНК включают ПЦР в реальном времени (TaqMan), полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ), аллель-специфической олигонуклеотидов (ASO), или даже сейчас массовые методы спектроскопии на основе. Так же, как ветеринар может хочу знать, если тест ВИК выполняется с помощью теста SNAP, по сравнению с в ELISA, по сравнению с Западной Тех, потому что каждый метод имеет разную чувствительность и специфичность, так же верно и для методов тестирования ДНК. Ветеринары должны будут стать отказ с различными подходами генетического тестирования, а не стесняйтесь испытательную лабораторию о своих методах и чувствительности и специфичности для своих подходов.

6.    Неточный Клинический диагноз - Ультразвуковое исследование сердца, эхокардиографии, является наиболее распространенным и в настоящее время единственным эффективным методом для обнаружения болезни сердца у кошек. Несколько исследований оценивали присутствие HCM в домашней короткошерстной и Мейн-кун кошки 34 - 36 . Не все болезни сердца является HCM и даже определение HCM можно обсуждать. Последовательное определение HCM не всегда используется всеми кардиологов, таким образом, есть некоторые трудности с соотнося генетический результат теста с отчетом ультразвука, особенно если подробно диагностические критерии не представлены в докладе. Неправильное толкование в ультразвуковых исследований может привести к различным толкованиям со статусом заболевания. В целом, единственный способ определить истинную опасность, присвоенное некоторых мутаций следовать кошек в течение своей жизни с общими диагностических процедур и по сравнению с генетическими результатов испытаний. Только время и продолжали наблюдение поможет определить истинную относительный риск, что мутации передать для сложных заболеваний. В случае HCM, различные исследования показали более высокие или более низкие риски в разных популяциях кошек, но ни один не был в состоянии следовать кошек на протяжении всей их жизни. Эти исследования важны и имеют большое значение для сообщества. Другие мутации должны быть найдены и сотрудничество заводчиков должно быть положительным и энтузиазма, чтобы иметь успешные исследования. Разведение Рекомендации
Заводчики кошек очень хорошо осведомлены в отношении взвешивания различных факторов для производства здоровых кошек, которые имеют хороший тип и темперамент. Многие генетические тесты помогают заводчик сделать более четкое и обоснованное решение. Кошки с положительным генетический тест на заболеваний должны быть экранированы от других диагностических средств, таких как ультразвука в случае ГКМ и ДОК, для определения состояния заболевания и эту общую информацию, используемую в селекционных решений. Другие здоровья, типа, и поведенческие атрибуты, безусловно, должны быть рассмотрены в рамках общей программы разведения. Однако заводчики должны упорно трудиться, чтобы уменьшить риски с любой проблемой в области здравоохранения. С A31p мутации HCM, каждая кошка, которая имеет мутацию в опасности для развития HCM и каждая кошка с мутацией будет передать его на все или некоторые из его потомков. Кошки, которые гомозиготных по мутации A31p, безусловно, пройти мутацию своим потомкам. Гомозиготные кошки имеют высокий риск развития тяжелой HCM. Кошки, которые гетерозигот по мутации не должны использоваться в разведении, если они не имеют других качеств, которые либо очень полезно или необходимо породы. Котята, что испытывают недостаток по мутации должны быть использованы для замены их в генофонде. Медленный искоренение болезни рекомендуется для высоко распространенных заболеваний, таких как HCM и ДОК, а оперативное устранение такого большого количества кошек может привести к другим последствиям инбредной депрессии. Породы с очень низких популяций размеров, таких как Коратс, научились управлять gangliosidoses в своей породы, никогда не разведения носителей вместе. Будем надеяться, что все мутации болезнь может быть в конечном итоге искоренить, но хорошие решения разведение и пуско разнообразие населения должны быть рассмотрены.
Перейти к:
Генетическое тестирование Обеспокоенность в разных пород или популяций
После того, как мутация идентифицируется для гена, который вызывает определенный цвет пальто или заболевания, лаборатория службы, либо в связи со следователем, который нашел мутацию, или независимую коммерческую лабораторию, создаст генетический тест для этой мутации, чтобы предложить общественность ( Таблица 3 ). Почти десяток лабораторий по всему миру в настоящее время предлагают генетический тест на ДОК у кошек. Все лаборатории может быть технически очень хорошо и точно, но, не все из них одинаково "знают своих кошек". Таким образом, некоторые из проблем, с специфичности и чувствительности генетических тестов, особенно в отношении тестирования в гибридных пород кошек, связано с недостатком знаний о том, как разрабатываются породы кошек и кошек эволюционных взаимоотношений.
 
Таблица 3
Домашняя кошка тестирования ДНК лаборатории.
В таблицах 1 являются все известные генетические мутации в кошки, которые были опубликованы и могут быть беспокойства для генетического тестирования. В случае заболеваний, заболеваний обычно присутствующие в определенной породе, таким образом, только связанный с этой породы. Тем не менее, некоторые породы разрешается ауткросс с другими, а некоторые являются законными или незаконно использованы, чтобы помочь уточнить "взгляд" из другой породы. Сиамские и персы оба имеют множество других пород кошек, что они повлияли. Следовательно, любая мутация находится в одной породы могут быть найдены в других, если скрещивание произошло. Кроме того, кошки разводят во всем мире, и правила между реестрами и ассоциаций, не всегда то же самое. Ауткросс, что может быть приемлемо для Международной Ассоциацией Кота (ТИКА) в США может быть неприемлемым для Ассоциации Знатоков Кота (КФА) или, возможно, Совета управляющих Cat Fancy (GCCF) в Соединенном Королевстве. Таким образом, испытательные лаборатории должны понять некоторые из этих динамики кот породы, так что они знают, тест действителен для данной породы в любой части мира и так, что тесты свободно предлагаются для пород, подверженных риску.
Почему один волнует, если генетический тест действителен в другой породы? Речь идет о том гетерогенность заболевания. Как владельцев, заводчиков и ветеринаров, мы видим клиническую картину, что является ненормальным в кот. Тем не менее, любой из нас может быстро перейти к выводам. У кошек есть много причин почечной недостаточности, не все почечная недостаточность, вызванные ДОК. Кошки имеют различные типы болезни сердца, не все заболевания сердца является HCM. Даже когда диагностика ГКМ является окончательным, не все НСМ вызвано тем же мутации. В данном документе линии концерна. Незнание ветеринар, владелец или заводчик можете кошка иметь генетический тест на HCM или ДОК потому что кошка имеет клинические признаки в соответствии с этими заболеваниями. Если тест показывает отрицательный результат, этот результат не означает, что кошка не имеет HCM или ДОК, если тест не имеет быть доказано в этой выбранной породы. Но, результат не означает, что кошка не имеют мутацию вызывает мейн-кун или Ragdoll HCM или Персидская кошка ДОК. Лаборатория может очень хорошо выполнить тест, но лаборатории имеют разные возможности и навыки с генетического консультирования. Ветеринар может быть сами по себе, чтобы понять смысл отрицательного теста, следовательно, почему тест, как правило, включена в список, относящихся к конкретной породы. До достаточно кошек из конкретной породы не выступить с клиническими данными, такими как УЗИ диагнозов и генетических результатов испытаний, тест не может быть действительным для породы, если ясно ауткроссинг породам риска не является очевидным.
Кроме того, зная, кошек [J4], испытательные лаборатории должны знать свою генетику, а также. Последовательность белка для генетической мутации в гене тирозиназы, что приводит к мутации, общую для сиамских кошек «точки» 37 , представлен в рисунке 1а . Некоторые должности в последовательности имеют различные аминокислоты между видами, больше между кошками и людьми, чем между кошками и собакой, так как кошки и собаки поближе эволюционную историю. Эти белковые изменения являются нормальными различия между людьми, собак и кошек. Но, изменение глицин (G) на аргинин (R) в кошки то, что делает кошка есть «точки». Эта простая мутация вызывает температурную чувствительность в белке, белка, который производит меланин, который тогда только функции в тех областях, где температура тела кошки ниже, лица, лапы, уши и хвост, «точки». Тем не менее, в ДНК последовательность ( 1б ), три нуклеотида объединяются, чтобы код для одной аминокислоты. Таким образом, ДНК-последовательность, в три раза больше, чем для белковой последовательности данного белка. Четыре нуклеотидов (А аденин, G является гуанин, С цитозин и Т тимидина) составляют ДНК. Кодирование аминокислот имеет встроенные избыточности. Аминокислота глицин могут быть закодированы последовательностью ДНК GGG, GGC, GGA или ГГТ. Единственное изменение нуклеотид гуанина (G) на аденин (А) изменяет аминокислоту из глицина на аргинин, и это делает кошки имеют точки, когда обе копии их ДНК имеет такую же изменение. Мутация может произойти в любой нуклеотидной сайта. Если CCT CCC стали, тимидин (T) изменяется на цитозин (С). Это изменение не влияет на аминокислоту, она по-прежнему коды для пролина. Этот тип мутаций называется молчание мутации, так как он не влияет на белок. При охоте на важных мутаций, молчаливые мутации, как правило, со скидкой, нормальное генетические вариации найдены между отдельными лицами или видов. Мутация, которая не меняет сумму, выражая сроки и структуру белка вообще не будет иметь изменение оказывает влияние на фенотип или здоровья. Однако эти молчащие мутации и варианты ДНК может нанести ущерб генетического теста. Например, Сибирская кошка из Италии с желтыми глазами, который был доминирующим белым был представлен для генетического тестирования определить основополагающие пальто цвета аллели. Генетический тест для Цвет (TYR) мутаций предложил кот был гомозиготные по острым мутации. Если это так, кошка должен был иметь голубые глаза, независимо от того доминирующим белым. В этом случае, кот был нормальный, но тихий, вариант в последовательности вокруг мутации для точек ( рис. 1в ). Обратите внимание, кошка имеет только один аллель для точек, в нижней строке, но в верхней строке имеет тихий мутацию. Поскольку последовательность не была нормальная последовательность перед важной сайте мутации, тест не для этого аллеля и результат теста предложить кот был гомозиготным для точек. Хороший лаборатория знает это может произойти и имеет другие способы обнаружения этих ожидаемых проблем. Потому что лаборатория была сильные взаимодействия с заводчиками, тест был переработан для учета этой аномалии.
 
Рисунок 1
Генетическая последовательность для мутации кошка "точки"

Генетическое тестирование Обеспокоенность в гибридный пород кошек.

Нормальный уровень вариации между кошек, как ожидается, будучи намного меньше, чем 1% от последовательности, которая кодирует белок. В этом и заключается проблема для гибридных пород кошек. Эволюционный время между видами кошачьих миллионы лет 38 , а не сотни тысяч между кошкой пород и популяций. Азиатский кошка леопард имели общего предка с домашней кошки около 6 миллионов лет назад, рысь около 8 миллионов лет назад, Serval около 9,5 миллионов лет назад. Джунгли кошка более тесно связаны с домашней кошки, чем леопарда кошки к домашней кошки. [J5] Кроме того, для некоторых из этих диких видов кошачьих, разные подвиды были включены в породе.Последовательность ДНК между домашней кошки и один из этих диких видов кошачьих будет много генетических различий, может быть, несколько процентное различие, меньше для кошки джунглей, больше для Серваль по сравнению с домашней кошки. Генетические различия, скорее всего, молчащие мутации, но, изменение будет Interplay с генетическими анализами и может привести к более аллельный отсева чем можно было бы нормально предполагалось. Нет генетические тесты не были проверены в гибридных кошек пород, хотя они, как правило, используется очень часто.
Большинство лабораторий признать, что мутации болезнь специфичны для пород, но, а не пальто цвета. В окраса мутации произошли во время раннего одомашнивания кошки до разработки породы, поэтому, все породы, как правило, имеют одинаковую мутацию. Это верно для всех пальто цвета испытаний до сих пор, но и для гибридных пород, таких как Bengals, Chaussies и саванн, может произойти некоторые странности в цвете пальто и тестирования болезни. Нормальная последовательность ДНК вокруг каждого из них мутации для окрасов должна быть оценена в многих людей друг от диких видов кошачьих, чтобы найти нормальные, молчащие мутации, которые происходят между диких кошачьих и домашних кошек. В любой момент гена, в Бенгалии, никто не знает, если у вас есть одна последовательность леопард кошка или два присутствуют. Таким образом, точность для любого генетического теста находится в не известных для гибридных пород кошек. Если отечественные аллели кошки присутствуют, тест будет работать некорректно. Но, один никогда не знаете, когда один аллель или оба от кошки леопарда. Что, как правило,, выбор в пользу диких кошачьих окраски, поэтому, по сути, порода выбрана для ДНК-последовательностей, которые могут вызвать генетические тесты на провал.
Перейти к:
Другое недопустимое Генетическое тестирование
Генетические лаборатории тестирования пытаться предоставить лучшие услуги по самым низким ценой. Многие из новых технологий позволяют более высокой пропускной способности образцов, а также выполнения более одного генетический тест в одном анализе, значительно снижая затраты реагентов и рабочей силы. Многие лаборатории тестирования стремимся быть как можно более полным, обеспечивая все доступные генетические тесты для любых данного вида. Тем не менее, в рвении конкуренции, несколько генетические тесты, которые предлагаются в кошки не имеют достаточного научного сопровождения. Любой генетический тест должен иметь изданию, что можно ссылаться, чтобы определить генетическую последовательность, окружающую мутацию, и обеспечить статистическую поддержку точности мутации для присвоения заболевания или признака интереса к конкретным пород и популяций. Опубликованные тезисы не являются рецензируемых статей и не имеют достаточно информации для определения точности теста, таким образом, тезисы не являются соответствующие ссылки для генетических тестов. Некоторые университеты или исследователи выделяемых компаний и их открытия могут быть защищены лицензирования или патента, возможно, никогда не публикует данные для конкурентного преимущества. Таким образом, некоторые генетические тесты могут быть найдены только с определенными тестирования компаний. В настоящее время, запатентованные тесты для кошек включают ДОК, HCM, мутации для тирозиназы на цвет локуса, которые придают сиамских и бирманских стиле «точки» и тип Тип B крови 39 . Тем не менее, лицензирование доступно для каждого из этих испытаний и патенты относятся только к США. Некоторые компании будут нарушать эти патенты, как общий доход в университет, как правило, очень низка, таким образом, вероятность того, что университет будет применять патент будет низкой, поскольку стоимость будет непомерно высока. Тем не менее, нарушение генетических патентов испытаний не поощряется и вообще считается нецелесообразным.
Кроме патентных нарушений, некоторые лаборатории предложит генетические тесты, которые не научно обоснованным появляться, чтобы получить конкурентное преимущество. Мутация в MYBPC3 для HCM сообщили в абстрактном, но никогда не был представлен в публикации рецензируемых. Нет поддержки для риска эта мутация наделяет для HCM у кошек не была хорошо документирована, но некоторые лаборатории предлагают тест для этого варианта ДНК. Лаборатории разместим отказы, часто оставляя ветеринар, владельца и заводчика, чтобы размышлять о том, испытаний общую влияние на кошек помощи.
Перейти к:
Вывод
Генетическое тестирование является важным диагностическим инструментом для ветеринара, заводчик и владелец. Генетические тесты не на 100% надежной и точность процедуры испытания и репутации и обслуживания клиентов генетического испытательной лаборатории необходимо учитывать. Некоторые черты очень желанный и генетическое тестирование может помочь селекционерам для более точного определения соответствующих Вязки, потенциально становится все более эффективные заводчики, тем самым снижая затраты и избыточное производство кошки. Другие черты или заболевания нежелательно, тем самым генетическое тестирование может использоваться для профилактики заболеваний и потенциально искоренения озабоченность со стороны населения. Генетические тесты для простых генетических признаков больше соответствуют прогнозирования черту или презентацию заболевания, но, как геномика прогрессировать для кошки, больше тестов, которые придают риск станут более распространенными. Ветеринары должны весить относительный риск того, мутация против наличия заболевания, как часть их дифференциалов и заводчики должны будут рассмотреть факторы риска наряду с другими важными атрибутами кошки для их размножения решений.
Перейти к:
Благодарности
Финансовая поддержка обеспечивается NIH-NCRR RR016094, Винн Feline Foundation, и Центром Companion Animal Health, школа ветеринарной медицины, Университет Калифорнии, Дэвис.
Перейти к:
Примечания
Издателя Отказ от ответственности: Это PDF файл из неотредактированном рукописи, которая была принята к публикации. В качестве услуги для наших клиентов мы предоставляем эту раннюю версию рукописи. Рукопись будет проходить Copyediting, верстки, и обзор в результате проверки, прежде чем он будет опубликован в окончательном citable форме. Обратите внимание, что во время ошибок производственного процесса могут быть обнаружены, которые могли бы повлиять на содержание, и все юридические оговорки, которые применяются к журналу относятся.